〈Geneious Pro〉．学部レベルの学生に分子系統解析を叩き込むツールとして推薦されている．〈PaupUp〉の発展形みたいなものか．フリー試用版あり．

Sean Lee の論文が発表された（本人からメールあり）：Sean Lee and Toshikazu Hasegawa (2011), Bayesian phylogenetic analysis supports an agricultural origin of Japonic languages. Proc. R. Soc. B. Published online before print May 4, 2011, doi…

Robert R. Sokal の元論文はpdfでゲットできるし，系統発生をアニメ化した動画まである．もともと Caminalculesは，形態解析の「教材」としてカンザス大学の昆虫学者 Joseph H. Camin が1960年代にトレーシングペーパーの上で“進化”させた架空生物群だ．進化…

Springer-Verlag から発行されている雑誌『Evolution: Education and Outreach』の編集長が Niles Eldredge だとは知らなかった．系統樹リテラシーに関する論考：T. Ryan Gregory 2008. Understanding evolutionary trees. Evolution: Education and Outreac…

Mark A. Ragan 2009. Trees and networks before and after Darwin. Biology Direct, 4: 43（open access）. 系統樹と系統ネットワークの図像史．知らない「絵」がいくつもあっておもしろい．著者に最初に会ったのはブダペストで1996年に開催された ICSEB だ…

お茶の水女子大の研究者からメールをもらった．系統推定論のひとつのテーマである「MUL-tree（multiple-leaved tree）」の研究史について調べているとのこと．ある同一のシングルトン（個々のtaxonやarea）が系統樹の末端に複数回出現する系統樹のことを「MU…

Liam Revell〈Phylogenetic Tools for Comparative Biology〉と〈R-phylogenetics ("phytools") beta version distribution page〉．

Spencer M, Davidson EA, Barbrook AC, Howe CJ. (2004), Phylogenetics of artificial manuscripts. Journal of Theoretical Biology, 227(4): 503-11. doi:10.1016/j.jtbi.2003.11.022 → abstract. 人造写本の実験的伝承過程からの系統推定を通した写本系…

Marcelo R. de Carvalho and Matthew T. Craig (eds.)『Morphological and Molecular Approaches to the Phylogeny of Fishes: Integration or Conflict?』Zootaxa, 2946 [Special Issue]: 1-142 (8 July 2011) → サイト（open access）．単に「魚の系統」だ…

Rod Page - iPhylo「Talk @vizbi on phylogeny visualisation」（Vimeo） と「スライド」（SlideShare）いずれも VizBi2011: Workshop on Visualizing Biological Data でのトークの公開（2011年7月12日）．

NAGGLY.COM「巨大な円形の生物種進化系図ポスター「Tree of Life」」（2011年7月10日）．こういう「Circle tree」は可視化の絶品だと思う．系統樹を円形や球状に系統樹を描画するというのは，全体を一望できるという点で利点があるということだろう．中世の…

hellog〜英語史ブログ「言語系統図と生物系統図の類似点と相違点」．ここに書かれているように，オブジェクト（言語と生物）が異なれば，伝承プロセス（変遷過程）に関するちがいがあるのは当然．むしろ，オブジェクトが異なるにもかかわらず，系譜パターン…

ASCII.jp×ビジネス「Androidに至るモバイル進化の系譜」（2011年07月20日）．「モバイル進化系統樹」の画像をさっそくリンク．お座敷でのネタとして．

EvoViz: Tree Visualization Software．系統樹のビューワーがいろいろあるなあ．講義ツールとしての選択眼でつい比較してしまう．

Lambert de Saint-Omer の『Liber floridus』（1192）に所収されている「美徳の樹 / 悪徳の樹（arbor bona / arbor mala）」は，デジタル図版集：BibliOdyssey : 「Liber Floridus」（2011年12月19日）に公開されている．同じく：Scene de crime : Sébastien…

「日本全国お雑煮文化圏地図」 versus 「全国アホバカ分布図」．お雑煮についてはちゃんとした系統解析の卒論がコマバに保管されている．食文化的構築物と言語の地理的分布に関する一致性の程度がちょっと気になる．

Autodesk Research「Citeology: visualizing paper genealogy」．論文の引用系譜の可視化ツール．まるで gene tree を復元しているようなもの．ついでに関連記事も：「Citeology: Visualizing the Relationships between Research Publications」（2011年12…

H. S. Collín and C. J. Schlyter (eds)『Corpus iuris Sueo-Gotorum antiqui: Samling af Sweriges gamla lagar, på Kongl. Maj:ts. nådigste befallning, 13 vols』（1827〜1877年刊行, Haeggström, Stockholm → Internet Archive）．1827年に出版された第…

〈raxmlGUI〉：最尤系統推定ソフトウェア〈RAxML〉のGUI版 → ダウンロード．参照：D. Silvestro and I. Michalak (2011) raxmlGUI: a graphical front-end for RAxML. Organisms Diversity & Evolution. DOI: 10.1007/s13127-011-0056-0.

生態学者イヴリン・ハッチンソン（George Evelyn Hutchinson）の師弟系統樹が公開されている（→ jpg）．なかなかみごとな「枝ぶり」ですな．この師弟系統樹の出典は：Yvette H. Edmundson 1971. Some components of the Hutchinson legend. Limnology and Oc…

TaxaCom「Edward G. Voss - 1929-2012」（2012年2月13日）．ワタクシが Voss の名前を知ったのは，系統樹の図像史に関して書かれた60年前の彼の論文を通してだった：Edward G. Voss 1952. The history of keys and phylogenetic trees in systematic biology…

Banister F. Fletcher『A History of Architecture on the Comparative Method for the Student, Craftsman, and Amateur, Fifth Edition』（1905年刊行，Scribner's Sons, London → OpenLibrary） ※建築様式系統樹が載っている（表紙口絵）．

Rod Page @rdmpage Space, time, form: viewing the tree of life. TREE 27(2): 113-120, 03 January 2012 → open access.

クレヨンの系統発生の可視化と「クレヨラの法則」について：WIRED Archives「「クレヨンの進化の法則」を図で表示」（2010年1月20日）→ 原記事：WIRED - Chuck Lawton「Is There an Upper Limit to Crayola’s Law?」（2010年1月19日）．要するに，1903年に C…

『ポケ論！：語られざるポケモンの秘密を暴く』（2012年5月刊行 → ポケジェクト本部紹介ページ ※サンプルあり）．にしむらたかひろ「ポケモン系統樹描けるかな？」所収．形態形質と行動形質からの系統解析の「考え方」への格好のイントロになるだろう．「ポ…

J. David Archibald 2009. Edward Hitchcock’s Pre-Darwinian (1840) 'Tree of Life'. Journal of the History of Biology, 42: 561–592 → pdf．ここに掲載されている「彩色樹& lt;/a>」はけっして系統樹ではなく，Louis Agassiz 流の創造説仕込だそうだ．

コンピューターのハードウェア系統樹「<a href="http://longstreet.typepad.com/thesciencebookstore/2012/06/the-family-tree-of-computer-development-part-ii.html">The Family Tree of Computer Development, Part II</a>」／コンピューター言語の系統樹もまたおもしろい： <a href="http://www.levenez.com/lang/">Computer Languages History</a>．系統樹曼荼羅本のネタにしよう…

松井哲也（神戸大学大学院理学研究科）「ツインテールの系統樹：「萌え要素」の文化系統学的研究」→ 日本マンガ学会第12回大会．2012年6月23日（土）〜24日（日）＠明治大学駿河台キャンパス・リバティタワー（→ 大会案内）．

Kurt Stüber | Stammbäume basteln ※形質マトリクスをつくれば最節約系統樹が．無作為化形質マトリクス（「Zufall」）がデモ用に使えそうかな．

幼稚園や小学校などの音楽授業で使われる〈青赤のカスタネット〉はほんとうは〈ミハルス〉と呼ぶのでいないかとのウワサが飛び交ったが，それはまちがいであることが判明した．要するに，通常のスペイン舞踊で使う〈カスタネット〉と日本の〈ミハルス〉，さ…